有机肥生产设备主要是发酵部分和生产造粒部分。有机肥原料即便是发酵比较好，造粒也比较困难，因为有机原料的特点是原料粗糙，较轻，粘结率比较低。不同的有机原料都有不同的特点，因此选设备时，应特别慎重，不然不但会影响产量，而且造出的产品外表也达不到要求的程度。
        设备的选择需注意的几大关键因素：发酵的方式、何种有机原料、机械化程度，年产量。　        
有机肥内在品质做得好坏主要看发酵部分及产品的配方。发酵部分的关键因素有：微生物、碳氮比、碳磷比，水分，PH值、曝气控 制。如果一种因素控制不好就会产生不发酵，或是发酵时间长的状况。有机无机复合肥产品配方和无机肥一样也要根据不同的土壤，不同的作物配方也 有差别。如果发酵充分配方得当，效果比无机肥还好，造价低，并且为绿色肥料，还能改良植物生存的环境和土壤的团粒化。 有机肥有养分含量高、副成分少且物理性状好等优点，这些优势对于提高肥料利用率，平衡施肥，刺激作物的高产稳产有着关键性的作用。但它在不同土壤和不同作 物所需的营养元素种类、数量和比例这样多样性的状况下，养分比例还总是保持一样。因此，使用前要进行测土，了解田间土壤的质地和营养状况，另外也要注意 同单元肥料配合施用，才能使其发挥更佳的效果。