1、能达到无害化处理标准。科学试验证明：畜禽粪便需要在60-70℃高温下连续发酵10天左右才能杀灭其中的有害病毒、病菌、病虫害和杂草种子。有机肥生产过程是畜禽粪便在生物菌的分解作用下逐渐升高温度，并保持60-70℃，连续10天以上。所以处理畜禽粪便采用发酵模式基本能杀灭畜禽粪便中病毒、病菌、病虫害和杂草种子达到无害化处理标准。
2、是清洁、净化环境的生产过程。生物菌发酵法生产技术，按环保标准要求设计生产设备和生产工艺。经EM菌种发酵处理的畜禽粪便很快消除臭味。发酵之后再运输、进行二次处理、包装到田间施用都不会有异臭味。所以，是清洁、净化环境有机肥料。
3、使植物更易吸收，增强了有机肥的效果。生物菌发酵法生产技术，处理畜禽粪便是在生物菌的分解作用下进行，温度逐渐升高，并保持60-70℃之间，对畜禽粪便中的营养形不成损失，反而使粪便中，大分子养分向小分子养分的转变并衍生出更多有利作物生长的物质，这样的有机肥使植物更易吸收，增强了有机肥的效果。
4、有利于节约能源。生物菌发酵法生产技术，主要靠的是太阳能、生物能和少量电能。每生产出一吨粉状有机肥，耗电不足5度。
5、能分解各种农业固体废弃物。生物菌发酵法生产技术利用各种人、畜、禽粪便为主原料。可以多渗、少渗和不渗农作物秸秆，生产有机肥料。渗农作物秸秆好，畜禽粪便与农作物秸秆比例3:1，生产出的肥料有机质含量可达85%以上。秸秆还田能保持土壤结构，提高土壤肥力，有利农业生产，减少秸秆焚烧，有利环境卫生。
处理畜禽粪便采用生物菌发酵模式是处理畜禽粪便的通用办法，也是我国目前对畜禽粪便处理的强行要求。但是从国外进口设备，机械复杂、价格昂贵、生产成本高不适合我国国情。
建立集中养殖区，对畜禽养殖业实行集中管理、集中防疫、集中处理粪便是一种现代的集约化养殖模式，处理畜禽粪便采用的也是生物菌发酵模式，其处理成本会降低。建立集中养殖区，是养殖业发展的方向在我国推行才开始起步，建立集中养殖区有个发展过程。
当前养殖场(区)的畜禽粪便处理工作进展十分缓慢，诸多问题中主要的是养殖场老板，怕生产出的有机肥价格高卖不出去，怕设备投资过大收不回投资。农民需要价廉肥美的有机肥，可有机肥售价太高，只有经济作物才用的起。出现了生产加工---销售---市场需求不畅通问题。恒隆态有机肥技术推广中心特邀专家，留日农化博士后王岩先生、留日机械博士庄森先生在合作单位的配合下，经过几年研究和实践结合我国国情，从降低生产设备投入、改进生产工艺和减少中间环节入手，降低了有机肥生产成本，解决了这个难题。该项目已经通过河南省科技厅的验收和鉴定。该技术设备投资，1年收回投资，还有利润赚。
